Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms