Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
A4D1N5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
A4D1N5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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