Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms