Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms