Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms