Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNX6Q9UNH7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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