Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA3Q9UL41 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA3Q9UL41 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms