Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms