Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms