Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM248Q9NWD8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms