Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms