Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms