Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms