Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms