Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms