Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PACSIN1Q9BY11 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms