Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms