Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms