Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms