Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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