Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SEC22CQ9BRL7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEC22CQ9BRL7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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