Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms