Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms