Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2BQ99453 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms