Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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