Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUB2Q96DC9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms