Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms