Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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