Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms