Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-CQ95604 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms