Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms