Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF3Q92576 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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