Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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