Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms