Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP2Q7L804 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB11FIP2Q7L804 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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