Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCDC80Q76M96 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC80Q76M96 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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