Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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