Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms