Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms