Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms