Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPPQ6IPU0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms