Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms