Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms