Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms