Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC57Q2TAC2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC57Q2TAC2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms