Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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