Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms