Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms