Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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