Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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